Bol Inst Mar Perú. Vol. 39 (1): 79-95, enero-junio 2024
ISSN: 0458-7766 / e-ISSN: 2810-868X
DOI: https://doi.org/10.53554/boletin.v39i1.407
Artículo original
Beder Ramírez1,* Mervin Guevara1 Yuliana Saavedra1 Vanessa Montoya1 María Serna1
1 Instituto del Mar del Perú, Laboratorio Costero de Tumbes, Perú.
*Correspondencia. E-mail: bramirez@imarpe.gob.pe
Recibido: 19-05-2023, Aceptado: 12-04-2024, Publicado: 10-06-2024
RESUMEN
El virus del síndrome de las manchas blancas (VSMB), es uno de los principales patógenos de langostinos peneidos reportado a nivel mundial. Desde su primera aparición hasta la actualidad, el VSMB ha mostrado una notable capacidad para alterar su estructura genética, lo que ha dado lugar a diversidad de genotipos. Con el objetivo de detectar las variantes genotípicas del VSMB presentes en el cultivo de langostinos de la costa norte del Perú (Región Tumbes), en esta investigación, se evaluaron 89 muestras de branquias y postlarvas de langostinos infectados con el VSMB que fueron colectados entre los años 2014 y 2021. El análisis fue realizado mediante la PCR (reacción en cadena de la polimerasa) y secuenciamiento de regiones variables del ADN, ubicados en los marcos de lectura abierta (ORFs= open reading frame) 75, 94, 125, 14/15, 23/24 y un gen transposasa presuntiva. En comparación con los genomas de referencia del VSMB, todas las muestras analizadas presentaron deleciones de 5138 pb en el ORF 14/15, de 11110 pb en el ORF 23/24 y de 1338 pb en un gen transposasa presuntiva. A nivel de los ORFs 75, 94 y 125, se observó variación en la cantidad de secuencias repetitivas de 6 a 8, 1 a 3 y 2 a 13, respectivamente; esta variación permitió detectar hasta 8 genotipos de VSMB presentes en los langostinos de cultivo de la zona norte de Perú. El hallazgo inicial de estos genotipos representa un logro significativo que sentará las bases para futuros estudios epidemiológicos del VSMB en langostinos de cultivo y silvestres en esta región geográfica.
Palabras clave: virus del síndrome de las manchas blancas, ORFs, genotipos, Litopenaeus vannamei
ABSTRAC
The White Spot Syndrome Virus (WSSV) stands as a prominent pathogen affecting penaeid shrimp globally. Since its emergence, WSSV has shown a remarkable ability to alter its genetic structure, resulting in a diversity of genotypes. This study aims to identify the genotypic variants of WSSV prevalent in shrimp farming along the northern coast of Peru (Tumbes Region). A total of 89 samples of gills and postlarvae from WSSV-infected shrimp were assessed between 2014 and 2021. The analysis involved PCR and sequencing of variable DNA regions located within open reading frames (ORFs) 75, 94, 125, 14/15, 23/24, and a putative transposase gene. Comparative to reference WSSV genomes, all samples exhibited deletions of 5138 bp in ORF 14/15, 11110 bp in ORF 23/24, and 1338 bp in a putative transposase gene. Variability in repetitive sequence numbers within ORFs 75, 94, and 125 ranged from 6 to 8, 1 to 3, and 2 to 13, respectively. This variability enabled the detection of up to 8 WSSV genotypes within cultured shrimp populations in northern Peru. This initial discovery of genotypic diversity sets the stage for future epidemiological investigations into WSSV among both cultured and wild shrimp in this region.
Keywords: white spot syndrome virus, ORFs, genotypes, Litopenaeus vannamei
Figura 1.- Ubicación y número de muestras recolectadas por zonas de muestreo. A1:
Campos de cultivo de Zarumilla, A2: Campos de cultivo de Tumbes, A3: Campos de
cultivo de Contralmirante Villar. n= número de muestras recolectadas
